支撑生态环境部开展长江流域水生态考核试点工作，参与制定长江水生态考核办法及评分细则，开展区域水生态综合评价、考核等级划分等方法研究，支撑印发《长江流域水生态考核指标评分细则（试行）》（环办水体〔2023〕10号）；编制长江流域水生态评估年度报告；研究全国水生态考核目标设置与实现路径，开展水生态评价考核关键技术研究，参与制定长江、黄河等重点流域水生态环境综合状况评估办法。
支撑地方水生态调查评估修复等实践项目，先后开展《贵州省赤水河流域水生态调查评估与生态补偿绩效评估（一期）》《青海省流域水生态调查评价技术规范制定》《青海省长江、黄河流域水生态调查评价》《云南省六大水系及重要湖库水生态环境调查》《宿州市主要河流与湖泊水生态环境调查项目》《聊城市重点流域水生态调查评价》《无定河（鄂尔多斯段）流域水生态调查评估项目》《洛阳市黄河流域水生态调查评估》等水生态调查评估项目；基于阳澄湖、石臼湖等案例，探索“环境治理+生态修复”的湖泊治理技术。
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